单位缺席的情况下，仲裁员应在坚持中立原则的基础上理性对证据的取舍和证明力进行自由判断并形成确信，也就是对证据进行实质性的审查，以此认定案件事实并作出裁判。

法律依据

《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第三条