公司不按规定克扣工资可以进行劳动仲裁，如果对仲裁结果不满意的也可以起诉公司，但是要确定克扣工资的原因是否属于公司可以合法扣减员工工资的情况。

法律依据

《工资支付暂行规定》

第十五条： 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：(一)用人单位代扣代缴的个人所得税;(二)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用;(三)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费;(四)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。