股权转让款当然可以分期支付，只要双方协商一致并在《股权转让协议》中约定清楚即可。
注意：《股权转让协议》中可以以对方履行一定义务作为支付每期转让款的条件。

法律依据

《最高人民法院关于审理买卖合同纠纷案件适用法律问题的解释》第三十二条

法律或者行政法规对债权转让、股权转让等权利转让合同有规定的，依照其规定；没有规定的，人民法院可以根据民法典第四百六十七条和第六百四十六条的规定，参照适用买卖合同的有关规定。