应纳税所得额=工资收入金额－各项社会保险费－起征点(5000元)，

应纳税额=应纳税所得额x税率－速算扣除数，

100万年薪除以12减去五险一金减去起征点(5000元)之后乘以10%的税率再减去2520的速算扣除数乘以12就是应该缴纳的个人所得税。

法律依据

《中华人民共和国个人所得税法》

第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：

(一)工资、薪金所得;

(二)劳务报酬所得;

(三)稿酬所得;

(四)特许权使用费所得;

(五)经营所得;

(六)利息、股息、红利所得; (七)财产租赁所得; (八)财产转让所得;

(九)偶然所得。

居民个人取得前款第一项至第四项所得(以下称综合所得)，按纳税年度合并计算个人所得税;非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。