分公司的账务不是单独核算的，而是由总公司一并处理。分公司不是独立法人，其账务可以不单独核算，而并入总部处理，分公司作为内部核算单位，只做往来账。可设置“内部往来”的会计科目，处理内部往来款。
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法律依据

《会计准则第33号——合并财务报表》第二条,合并财务报表，是指反映母公司和其全部子公司形成的企业集团整体财务状况、经营成果和现金流量的财务报表。

《公司登记管理条例》第四十六条,分公司是指公司在其住所以外设立的从事经营活动的机构。分公司不具有企业法人资格。分公司的名称应当符合国家有关规定。分公司的经营范围不得超出公司的经营范围。