历史争议

在丁卯之役中，最具争议的就是明朝东江镇(东江镇治所为皮岛)总兵毛文龙的动向。据毛文龙前后塘报，他在战前就已经做了准备，从正月十四日开始，六王子(济尔哈朗)率4万人，在当地朝鲜人的引导下全力进攻明军，攻克铁山，都司毛有俊自杀未遂，刘文举被俘而死。大王子(实为二贝勒阿敏)领兵4万攻打云从岛，毛文龙在正月十五日夜袭阿敏部，打死后金兵数百人，但自己也损失700余人，十七日夜又将2300余名投降女真人全部杀死，阿敏没有内应，无奈只好于十九日撤退，然后迁怒朝鲜，便攻打郭山、安州等处。毛文龙称他的主力都被调遣去过江牵制，手下虽有二万余兵，但缺乏粮食，无法正面抗击后金，只能一面“安安静静……坚壁固守”，一面布置兵力，相机援朝，乃于正月二十二日向明廷乞求粮饷。过了一个月，毛文龙自称在二月二十一日分别于义州西门和晏庭关口两处袭击后金兵，多有斩获，二十二日其部将毛永诗(孔有德)也在小铁山伏击了后金兵，并联络朝鲜义兵不断骚扰侵朝后金兵，在其打击下阿敏被迫撤出朝鲜。毛文龙对战果总结道：“一胜于宣州、车辇、江当、沟小、铁山等战，再胜于义州、晏庭关、琼山、青龙山等战，三胜于积粮仓、千家庄、弥川堡、镇江沿边等战，四胜于云从关、口龙、王宛子。本镇亲督内丁之鏖战，五胜于会哨。国王彼此夹攻，逼贼于瓶山(平山)之远战，计各路相机攻杀，死伤悍虏无数”，而他本人也亲中二矢。根据李嵩的题本的内容：“奴以十万之众蹂躏东江，毛文龙乃能于狂烽正炽之际，奋敌忾迅扫之威。今解到活夷三名，夷级四百七十七颗，达帽二百九十顶。逐一验视，历历皆真。毛帅之功，于是乎不可及矣!”此为丁卯之役毛文龙所得战果。

但是，毛文龙自己的捷报不仅与后金相左，也得不到其他史料的有力支持。在毛文龙是否与后金有过交战的问题上，后金方面如是说：“时毛文龙遁往海岛，未能擒获”。明朝方面，在丁卯之役后被毛文龙请求朝廷叙功的关宁援军中的一员、水军游击周文郁否认了毛文龙与后金作战取胜、保全属国之说，他记载道：“奴于丁卯灯节前用(李)良梅向导，潜克铁山，时龙以在云从过节幸而免，奴复破朝鲜黄海等四道，自是知龙不能大有为。”后来袁崇焕矫诏杀毛文龙，称他有“十二当斩”，其中第十一条就是丁卯之役时“奴酋攻破铁山，杀辽人无算，文龙逃窜皮岛(实为云从岛)，且掩败为功。”朝鲜方面给明朝的奏报也称：“是日(十四日)夕，前锋已至定州，一枝大队分向宣川浦口，要抢毛将，毛将自冰合后驻云从岛，贼兵不得入，将蛇浦所住辽民及毛镇军兵尽行厮杀。”二月五日，朝鲜大臣崔鸣吉抱怨说：“我国被此兵祸，而渠(指毛文龙)不出一兵相救。”对此，毛文龙是这样辩解的：“乃有谓臣退居云从，不闻一矢加遗，不知铁山与云从地脉相连，惟潮涨难渡，退则不过二三里之隔，冬春冻潮不长，方围数百里结冰平坦，人马通行，其水陆程途，地里险易，臣上年遵旨自己审处奏报内，一一详明，当事者何不取疏揭而览之?”

而在朝鲜史书中能够确认的毛文龙战绩是其二月在龟城西北的青龙山城打败后金兵和三月在千家庄袭击后金运粮队，以及支援少(小)为浦李立、龙骨城郑凤寿等朝鲜义兵将领坚守龙川龙骨山城，到六月下旬溃散弃城，平安监司金起宗等称，城中明军皆被杀死，同时毛文龙与东援的监军太监胡良辅也在义州附近被后金打败。此外，毛文龙还犒赏过李忠杰等朝鲜义兵将领，收留避难的朝鲜官民。另据出使皮岛的朝鲜官员申达道的报告，战争开始时确实有朝鲜百姓为后金向导，导致毛部对朝鲜民众大开杀戒，即便是战争结束后，杀戮并未停止，毛部仍有抢劫朝鲜船只、残杀朝鲜百姓的劣迹，还有汉人杀死朝鲜百姓冒充后金兵来向毛文龙讨赏之事。

战争影响

对后金而言，丁卯之役是一次大捷。首先，后金从朝鲜掠夺大量粮食和物资，对其饥荒有所缓解;战后朝鲜不得不承诺不再接纳逃人，困扰后金的逃人问题也在一定程度上获得解决;第三，朝鲜被迫与后金结为兄弟之国，建立外交关系，一面向后金输岁币，包括杂色绸六百匹、白苎布二百匹、白布四百匹、杂色木绵二千匹、正木绵五千匹、豹皮五十张、水獭皮二百张、青黍皮一百六十张、霜华纸五百卷、白绵纸一千卷、彩花席五十张、花纹席五十张、龙席一张、好刀八柄、小刀八柄、丹木二百斤、胡椒、黄栗、大枣银杏各十斗、干柿五十贴、全鳆十贴、天池、雀舌茶各五十封;一面则被迫开市于义州中江，自1628年后每年送后金2000石粮食，交易1000石粮食，解决了后金的燃眉之急。在这次战役中，后金主将阿敏不顾众人反对，屡次扬言要入居汉城，并在给朝鲜的书信中暗示了欲称王于朝鲜的念头，使皇太极知其不臣之心，成为他留给皇太极的一大把柄。三年后皇太极惩治阿敏的“十六大罪”中的第二条便是阿敏在丁卯之役中“心怀异志”。

对朝鲜而言，因丁卯之役而蒙受的直接损失是相当惨重的，不但城池被毁坏、军民被屠杀，还有很多朝鲜人成了后金的俘虏，仅清川江以南六邑就近5000名朝鲜人被掳走(600余人逃回)，作为战争重灾区的清川江以北只会远多于此;另一方面，丁卯之役的结果虽说是“暂事羁縻”，也无异于奇耻大辱，仁祖政权的形象进一步下跌，陷入合法性的困境。丁卯之役结束后，住在江原道横城的前官员李仁居便以仁祖政权“与奴贼相和”为由举事，并批评仁祖不但不卧薪尝胆，反而与后金频繁往来，为“天地神人之所共愤”。当然，仁祖政权并非甘心就范，在给后金的礼物上偷工减料、抵触会宁开市、不认真遣返逃人及禁止越境采参等，最重要的是没有断绝和明朝的关系，因而引发九年后皇太极亲征朝鲜的“丙子之役”，后金与朝鲜的关系问题才尘埃落定。

毛文龙宣称他在丁卯之役中取胜，以抗金援朝、保全属国之功自居，明廷嘉奖毛文龙与魏忠贤，并拨给毛文龙十万余两白银、五万石粮食。毛文龙还移咨责怪朝鲜人为后金向导，无视朝鲜的抵抗，令朝鲜极为不满。朝鲜平安道观察使金起宗谴责道：“毛将持兵在岛中，不敢窥贼左足，而只以日献伪捷，厚罔天朝。”在北京的朝鲜使节金尚宪也极力辨毛文龙塘报中对朝鲜之诬，所幸明廷并不在意。朝鲜在战争期间向明朝发送告急咨文，被毛文龙阻拦而未果;战后朝鲜上奏明廷，在详细汇报战况时有言：“毛镇驻扎岛中，势未及出海而相援”。毛文龙看到朝鲜给他的咨文中有埋怨他不援助的内容，暴跳如雷，除了要求删除此内容外，还不许朝鲜将讲和之事奏报明朝，极力阻止奏闻使权怗一行。权怗被迫将奏文打回朝鲜政府，朝鲜政府违心删改奏文(但未删讲和之事)后，毛文龙才转怒为喜，允许朝鲜奏闻使赴明。其时明熹宗驾崩，弟弟信王朱由检继位，是为崇祯皇帝，对朝鲜奏报予以优诏答复。总之，朝鲜认为毛文龙在战争中没有提供给他们什么支援，以致他们不得已缔结屈辱盟约。经过丁卯之役，毛文龙与朝鲜政府的关系彻底弄僵，朝鲜仁祖甚至骂毛文龙“与禽兽无异”。