检察机关负责判决寻衅滋事案中的批捕。
根据法律程序，检察院需对公安机关申请批捕的案例进行审核，并根据实际情形决定是否批准逮捕。
若获批，公安机关应即时执行，同时向检察院通报执行状况。
【法律依据】
《刑事诉讼法》第九十条，人民检察院对于公安机关提请批准逮捕的案件进行审查后，应当根据情况分别作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。
对于批准逮捕的决定，公安机关应当立即执行，并且将执行情况及时通知人民检察院。对于不批准逮捕的，人民检察院应当说明理由，需要补充侦查的，应当同时通知公安机关。