三方协议和劳动合同存在明显区别。

从性质上看，三方协议是普通民事合同，主要是明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务。而劳动合同则是受劳动法调整的特殊合同，旨在规范用人单位与劳动者之间的劳动关系。

从主体及适用法律上，三方协议主体是毕业生、用人单位和学校，适用民事法律；劳动合同主体仅为用人单位和劳动者，适用劳动法律法规。

从内容上，三方协议主要涉及毕业生就业意向等，较笼统；劳动合同则对工作内容、工作条件、劳动保护、劳动报酬、社会保险等做详细明确的规定。

总之，三方协议是毕业生就业的前置程序，劳动合同才是真正建立劳动关系的依据。

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