三方协议和劳动合同在性质和作用上有明显区别。三方协议是《普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，主要用于明确毕业生、用人单位和学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务。它更多是一种就业意向，不具备劳动合同的诸多要素。
劳动合同则是用人单位与劳动者之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。具有较强的法律约束力，对工作内容、工作条件、劳动报酬、社会保险等劳动权利义务进行详细规定。
三方协议在毕业生到单位报到、用人单位正式接收后即终止，之后应签订劳动合同。签订劳动合同后，双方的劳动关系受劳动法律法规严格保护。

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