公司扣除员工基本薪资是否属于违法行为，需视具体情况而定。
一般而言，若企业无法律依据及适当理由便擅自扣除，那么无疑涉嫌违法，例如劳动合同中已明确规定基本薪资数额，企业未经员工同意擅自扣减，即违背了合同约定。
然而，若员工有违反公司规章制度、给公司带来经济损失等法定或约定的行为，企业依照合法有效的内部规定进行扣薪，则未必违法，但必须承担提供证据以证明其合法性及合理性。
综合分析来看，判定企业扣薪是否违法，应全面衡量扣薪的原因、依据及其执行流程是否遵循法规守则。

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