协议离婚时若涉及两个孩子的抚养权归属问题，主要依据《中华人民共和国民法典》相关规定。

首先，夫妻双方应本着有利于孩子身心健康和保障孩子合法权益的原则，协商确定孩子的抚养权归属。可以是一方抚养两个孩子，也可以是双方各抚养一个孩子。

若双方协商一致，应当在离婚协议中明确约定孩子随哪一方生活，未直接抚养方应承担的抚养费数额、支付方式、探视权的行使方式等。

如果双方对孩子抚养权无法达成一致，法院一般会综合考量双方的经济状况、抚养能力、孩子的意愿等因素来判决。总之，协议离婚中关于两个孩子的安排，应以双方自愿协商且不损害孩子利益为前提。

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